Aplicação dando 100% CPU... Preciso resolver esse problema.

Eu tenho uma aplicação ( emulador ) que conecta com o meu banco de dados e ele gerencia todo o meu jogo online. Mas quando chega perto dos 900 onlines ou 1.000 ele trava e vai a 100% cpu. As vezes chega a 1.200 onlines e não trava, mas passa um tempo parece que ele envia uma consulta que trava o MYSQL fazendo o mysql travado e a aplicação vai para 100% CPU. Quero saber se alguem pode dar uma olhada nos códigos do meu emulador ( OPEN SOURCE ) para fixar o problema que causa 100% CPU. Uso MYSQL e aplicação C# ou .net ... Preciso que a aplicação pare de travar o servidor e desconectar os jogadores.